Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RabggtbP53612 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RabggtbP53612 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RabggtbP53612 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RabggtbP53612 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RabggtbP53612 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RabggtbP53612 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RabggtbP53612 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RabggtbP53612 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RabggtbP53612 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RabggtbP53612 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RabggtbP53612 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RabggtbP53612 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RabggtbP53612 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RabggtbP53612 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RabggtbP53612 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RabggtbP53612 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RabggtbP53612 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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RabggtbP53612 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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RabggtbP53612 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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RabggtbP53612 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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RabggtbP53612 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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RabggtbP53612 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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RabggtbP53612 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms