Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lbx1P52955 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lbx1P52955 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lbx1P52955 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Lbx1P52955 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lbx1P52955 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Lbx1P52955 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Lbx1P52955 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lbx1P52955 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lbx1P52955 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lbx1P52955 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lbx1P52955 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Lbx1P52955 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lbx1P52955 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Lbx1P52955 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lbx1P52955 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lbx1P52955 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lbx1P52955 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lbx1P52955 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lbx1P52955 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lbx1P52955 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lbx1P52955 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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