Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp1P52624 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp1P52624 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp1P52624 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp1P52624 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp1P52624 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp1P52624 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp1P52624 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms