Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

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Length 777 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CcnfP51944 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CcnfP51944 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CcnfP51944 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CcnfP51944 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CcnfP51944 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CcnfP51944 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CcnfP51944 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CcnfP51944 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CcnfP51944 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CcnfP51944 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CcnfP51944 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CcnfP51944 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CcnfP51944 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CcnfP51944 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CcnfP51944 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CcnfP51944 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CcnfP51944 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CcnfP51944 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CcnfP51944 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CcnfP51944 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CcnfP51944 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnfP51944 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnfP51944 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnfP51944 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnfP51944 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnfP51944 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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