Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpreP49446 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpreP49446 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpreP49446 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpreP49446 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpreP49446 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpreP49446 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpreP49446 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpreP49446 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
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