Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cdkn1bP46414 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms