Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp3P28862 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms