Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrgP28705 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrgP28705 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrgP28705 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxrgP28705 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxrgP28705 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxrgP28705 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrgP28705 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrgP28705 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrgP28705 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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