Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms