Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa5P28312 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa5P28312 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa5P28312 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa5P28312 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa5P28312 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa5P28312 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa5P28312 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa5P28312 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa5P28312 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms