Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CebpbP28033 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CebpbP28033 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CebpbP28033 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CebpbP28033 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CebpbP28033 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CebpbP28033 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CebpbP28033 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CebpbP28033 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CebpbP28033 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CebpbP28033 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CebpbP28033 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CebpbP28033 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CebpbP28033 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms