Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl3P27659 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms