Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
U2af2P26369 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
U2af2P26369 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
U2af2P26369 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
U2af2P26369 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
U2af2P26369 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
U2af2P26369 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
U2af2P26369 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
U2af2P26369 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
U2af2P26369 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
U2af2P26369 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms