Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms