Protein–RNA interactions for Protein: P24610

Pax3, Paired box protein Pax-3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax3P24610 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax3P24610 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax3P24610 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax3P24610 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax3P24610 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax3P24610 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax3P24610 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax3P24610 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax3P24610 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax3P24610 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax3P24610 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax3P24610 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax3P24610 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax3P24610 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax3P24610 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax3P24610 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax3P24610 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax3P24610 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax3P24610 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax3P24610 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax3P24610 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax3P24610 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms