Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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