Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkchP23298 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkchP23298 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkchP23298 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkchP23298 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkchP23298 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkchP23298 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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