Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms