Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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