Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms