Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms