Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms