Protein–RNA interactions for Protein: P13609

Srgn, Serglycin, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrgnP13609 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SrgnP13609 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrgnP13609 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrgnP13609 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrgnP13609 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrgnP13609 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrgnP13609 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms