Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
OtcP11725 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
OtcP11725 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
OtcP11725 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
OtcP11725 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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OtcP11725 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
OtcP11725 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
OtcP11725 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
OtcP11725 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
OtcP11725 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
OtcP11725 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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OtcP11725 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
OtcP11725 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
OtcP11725 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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OtcP11725 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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OtcP11725 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
OtcP11725 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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OtcP11725 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
OtcP11725 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
OtcP11725 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
OtcP11725 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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OtcP11725 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtcP11725 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtcP11725 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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OtcP11725 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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OtcP11725 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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OtcP11725 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtcP11725 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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OtcP11725 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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OtcP11725 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtcP11725 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtcP11725 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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OtcP11725 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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OtcP11725 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtcP11725 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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OtcP11725 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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OtcP11725 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtcP11725 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtcP11725 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtcP11725 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtcP11725 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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OtcP11725 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtcP11725 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtcP11725 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtcP11725 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtcP11725 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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OtcP11725 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtcP11725 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtcP11725 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtcP11725 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtcP11725 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtcP11725 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtcP11725 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtcP11725 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtcP11725 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
OtcP11725 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtcP11725 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
OtcP11725 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtcP11725 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtcP11725 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtcP11725 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtcP11725 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtcP11725 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms