Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lamp1P11438 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms