Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PolP11369 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PolP11369 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PolP11369 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PolP11369 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PolP11369 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PolP11369 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PolP11369 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PolP11369 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PolP11369 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PolP11369 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PolP11369 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PolP11369 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PolP11369 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PolP11369 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PolP11369 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PolP11369 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PolP11369 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PolP11369 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PolP11369 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PolP11369 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PolP11369 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PolP11369 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PolP11369 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PolP11369 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PolP11369 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PolP11369 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PolP11369 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PolP11369 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PolP11369 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PolP11369 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PolP11369 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PolP11369 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PolP11369 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PolP11369 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PolP11369 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PolP11369 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PolP11369 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PolP11369 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PolP11369 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PolP11369 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PolP11369 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PolP11369 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PolP11369 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PolP11369 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PolP11369 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PolP11369 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PolP11369 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PolP11369 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PolP11369 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PolP11369 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PolP11369 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PolP11369 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PolP11369 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PolP11369 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PolP11369 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PolP11369 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PolP11369 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PolP11369 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PolP11369 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PolP11369 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PolP11369 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PolP11369 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PolP11369 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PolP11369 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PolP11369 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PolP11369 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PolP11369 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PolP11369 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PolP11369 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PolP11369 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PolP11369 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PolP11369 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PolP11369 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PolP11369 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PolP11369 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PolP11369 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PolP11369 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PolP11369 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PolP11369 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PolP11369 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PolP11369 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PolP11369 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PolP11369 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PolP11369 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PolP11369 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PolP11369 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PolP11369 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PolP11369 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PolP11369 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PolP11369 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PolP11369 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PolP11369 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PolP11369 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PolP11369 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PolP11369 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PolP11369 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PolP11369 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PolP11369 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PolP11369 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms