Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms