Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms