Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms