Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TnfP06804 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TnfP06804 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TnfP06804 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TnfP06804 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TnfP06804 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TnfP06804 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TnfP06804 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TnfP06804 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TnfP06804 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TnfP06804 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TnfP06804 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TnfP06804 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TnfP06804 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TnfP06804 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TnfP06804 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TnfP06804 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TnfP06804 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TnfP06804 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TnfP06804 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TnfP06804 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TnfP06804 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TnfP06804 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TnfP06804 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TnfP06804 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TnfP06804 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TnfP06804 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TnfP06804 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TnfP06804 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TnfP06804 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TnfP06804 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TnfP06804 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TnfP06804 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TnfP06804 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TnfP06804 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TnfP06804 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TnfP06804 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TnfP06804 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TnfP06804 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TnfP06804 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TnfP06804 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TnfP06804 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TnfP06804 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TnfP06804 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TnfP06804 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TnfP06804 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TnfP06804 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TnfP06804 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TnfP06804 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TnfP06804 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TnfP06804 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TnfP06804 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TnfP06804 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TnfP06804 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TnfP06804 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TnfP06804 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TnfP06804 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TnfP06804 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TnfP06804 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TnfP06804 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TnfP06804 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TnfP06804 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TnfP06804 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TnfP06804 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TnfP06804 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TnfP06804 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TnfP06804 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TnfP06804 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TnfP06804 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TnfP06804 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TnfP06804 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TnfP06804 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TnfP06804 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TnfP06804 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TnfP06804 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TnfP06804 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TnfP06804 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TnfP06804 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TnfP06804 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TnfP06804 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TnfP06804 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TnfP06804 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TnfP06804 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TnfP06804 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TnfP06804 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TnfP06804 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TnfP06804 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TnfP06804 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TnfP06804 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TnfP06804 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TnfP06804 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TnfP06804 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TnfP06804 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TnfP06804 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TnfP06804 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TnfP06804 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TnfP06804 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TnfP06804 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TnfP06804 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TnfP06804 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms