Protein–RNA interactions for Protein: P01791

Ig heavy chain V region HPCM6, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01791 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01791 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01791 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01791 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01791 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01791 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01791 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01791 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01791 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01791 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01791 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01791 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01791 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01791 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01791 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01791 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01791 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01791 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01791 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01791 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01791 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01791 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01791 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01791 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01791 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01791 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01791 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01791 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01791 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P01791 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01791 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P01791 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01791 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01791 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01791 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01791 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01791 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01791 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01791 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01791 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01791 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01791 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01791 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01791 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01791 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01791 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01791 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01791 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01791 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01791 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01791 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01791 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01791 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01791 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01791 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01791 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01791 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01791 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01791 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01791 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01791 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01791 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01791 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01791 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01791 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01791 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01791 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01791 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01791 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01791 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01791 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01791 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01791 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01791 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01791 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01791 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01791 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01791 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01791 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01791 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01791 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01791 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01791 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01791 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01791 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01791 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01791 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01791 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01791 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01791 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01791 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01791 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01791 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01791 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01791 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01791 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01791 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01791 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01791 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01791 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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