Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms