Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
E2f6O54917 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2f6O54917 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2f6O54917 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2f6O54917 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
E2f6O54917 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
E2f6O54917 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms