Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Rdh16O54909 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
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Rdh16O54909 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rdh16O54909 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Rdh16O54909 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Rdh16O54909 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rdh16O54909 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rdh16O54909 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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Rdh16O54909 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rdh16O54909 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rdh16O54909 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Rdh16O54909 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh16O54909 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Rdh16O54909 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh16O54909 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh16O54909 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh16O54909 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh16O54909 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh16O54909 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh16O54909 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh16O54909 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh16O54909 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh16O54909 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh16O54909 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh16O54909 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh16O54909 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh16O54909 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh16O54909 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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