Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms