Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms