Protein–RNA interactions for Protein: O09161

Casq2, Calsequestrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq2O09161 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq2O09161 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq2O09161 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq2O09161 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq2O09161 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq2O09161 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq2O09161 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casq2O09161 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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