Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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