Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
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