Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r167G3UW71 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r167G3UW71 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r167G3UW71 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r167G3UW71 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r167G3UW71 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r167G3UW71 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r167G3UW71 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r167G3UW71 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r167G3UW71 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r167G3UW71 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r167G3UW71 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r167G3UW71 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r167G3UW71 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r167G3UW71 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r167G3UW71 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r167G3UW71 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r167G3UW71 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r167G3UW71 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r167G3UW71 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r167G3UW71 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r167G3UW71 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r167G3UW71 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r167G3UW71 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r167G3UW71 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r167G3UW71 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r167G3UW71 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r167G3UW71 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r167G3UW71 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r167G3UW71 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r167G3UW71 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r167G3UW71 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r167G3UW71 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r167G3UW71 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r167G3UW71 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r167G3UW71 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r167G3UW71 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r167G3UW71 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r167G3UW71 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r167G3UW71 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r167G3UW71 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r167G3UW71 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r167G3UW71 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r167G3UW71 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r167G3UW71 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r167G3UW71 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r167G3UW71 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r167G3UW71 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r167G3UW71 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r167G3UW71 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Vmn1r167G3UW71 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Vmn1r167G3UW71 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Vmn1r167G3UW71 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Vmn1r167G3UW71 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Vmn1r167G3UW71 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r167G3UW71 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r167G3UW71 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r167G3UW71 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r167G3UW71 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r167G3UW71 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r167G3UW71 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r167G3UW71 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r167G3UW71 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r167G3UW71 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r167G3UW71 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r167G3UW71 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r167G3UW71 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r167G3UW71 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r167G3UW71 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r167G3UW71 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r167G3UW71 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r167G3UW71 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r167G3UW71 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r167G3UW71 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r167G3UW71 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r167G3UW71 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r167G3UW71 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r167G3UW71 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r167G3UW71 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r167G3UW71 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r167G3UW71 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r167G3UW71 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r167G3UW71 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r167G3UW71 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r167G3UW71 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r167G3UW71 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r167G3UW71 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r167G3UW71 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r167G3UW71 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r167G3UW71 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r167G3UW71 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r167G3UW71 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r167G3UW71 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r167G3UW71 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r167G3UW71 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r167G3UW71 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r167G3UW71 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r167G3UW71 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r167G3UW71 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r167G3UW71 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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