Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5218F6YH22 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms