Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5861F6VCN9 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms