Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21977F6U3N7 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21977F6U3N7 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21977F6U3N7 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21977F6U3N7 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21977F6U3N7 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21977F6U3N7 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21977F6U3N7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21977F6U3N7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21977F6U3N7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21977F6U3N7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21977F6U3N7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21977F6U3N7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21977F6U3N7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21977F6U3N7 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21977F6U3N7 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21977F6U3N7 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21977F6U3N7 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21977F6U3N7 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21977F6U3N7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21977F6U3N7 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21977F6U3N7 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21977F6U3N7 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21977F6U3N7 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21977F6U3N7 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21977F6U3N7 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms