Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm340F6RGI3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms