Protein–RNA interactions for Protein: E9Q658

Pate1, Prostate and testis-expressed 1, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate1E9Q658 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Pate1E9Q658 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Pate1E9Q658 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Pate1E9Q658 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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Pate1E9Q658 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Pate1E9Q658 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Pate1E9Q658 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Pate1E9Q658 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Pate1E9Q658 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Pate1E9Q658 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Pate1E9Q658 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Pate1E9Q658 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Pate1E9Q658 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pate1E9Q658 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms