Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20425E9Q035 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20425E9Q035 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20425E9Q035 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20425E9Q035 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20425E9Q035 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20425E9Q035 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20425E9Q035 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20425E9Q035 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20425E9Q035 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20425E9Q035 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20425E9Q035 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20425E9Q035 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20425E9Q035 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20425E9Q035 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20425E9Q035 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20425E9Q035 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20425E9Q035 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20425E9Q035 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20425E9Q035 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20425E9Q035 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20425E9Q035 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20425E9Q035 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20425E9Q035 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20425E9Q035 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20425E9Q035 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20425E9Q035 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20425E9Q035 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20425E9Q035 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20425E9Q035 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20425E9Q035 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20425E9Q035 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20425E9Q035 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20425E9Q035 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20425E9Q035 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20425E9Q035 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20425E9Q035 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20425E9Q035 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20425E9Q035 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20425E9Q035 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20425E9Q035 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20425E9Q035 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20425E9Q035 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20425E9Q035 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20425E9Q035 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20425E9Q035 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20425E9Q035 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20425E9Q035 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20425E9Q035 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20425E9Q035 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20425E9Q035 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20425E9Q035 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms