Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms