Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim12cD3Z3L3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms