Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3543D3Z235 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.2 ms