Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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